Sammenstøtene brøt ut i Krainik fredag og spredte seg mandag til hovedstaden i delstaten Vest-Darfur, Geneina.
En talsmann for guvernøren i regionen opplyser til nyhetsbyrået DPA at 201 mennesker er drept og 98 er såret de siste dagene.
Flyktninghjelpen melder om titusenvis av mennesker på flukt, bolighus som blir stukket i brann, angrep mot sykehus og plyndring av butikker.
– Landsbyer i Vest-Darfur brenner foran øynene våre, og lokalsamfunn blir angrepet gang på gang. Denne tragedien er raskt i ferd med å bli til en katastrofe, sier Flyktninghjelpens landdirektør i Sudan, Will Carter.
Det er uklart hva som utløste uroen, men ifølge enkelte kilder er det en vedvarende konflikt om vannressurser mellom fastboende bønder og nomader som driver med kveg, som har blusset opp igjen.
Andre rapporter tyder på at det er RSF-militsen, tidligere kjent som Janjaweed, som står bak angrepene i området.
Det har vært gjentatte sammenstøt i Vest-Darfur og i nabodelstatene Nord-Darfur og Sør-Darfur de siste månedene.
Volden truer den kommende innhøstingen av avlinger, og hjelpeorganisasjoner frykter at over 18 millioner mennesker trues av sult når høsten nærmer seg.